微生物小，却作用大！存在于植物根部周围，这样的区域称为“根圈”或“根际”，定义为“包围着植物根系并被根系影响的土壤”。植物根系会分泌像是光合作用产生的醣类和其他被微生物当作食物来源的植物产物。

土壤微生物，特别是根圈微生物，会用以下几种方式帮助植物：

1. 它们助于溶解并提供一些原本无法被根部吸收的植物养分。例如：一些类型的土壤真菌可以将低溶解度的含磷化合物(磷酸钙或磷酸铁)转换成可溶解的磷离子,变成可被植物使用的型态。
2. 一些根圈细菌会制造化合物，包括可促进和维持作物生长的植物贺尔蒙，特别是植物在遭受环境压力的状态下(例如：高湿、高温或寒冷逆境)，这些微生物被称作“植物根圈促生细菌(Plant Growth Promoting Rhizobacteria, PGPR)”, 包括Pseudomonas(假单胞菌属),Azotobacter(固氮细菌),Bacillus(芽胞杆菌属),Rhizobium(根瘤菌)等。
3. 一些土壤微生物族群会制造抗生素，可以降低害虫(例如：昆虫、真菌或细菌病原)数量的化合物。
4. 大量根圈细菌存在于根部周围可以形成物理屏障来阻挡病原菌之感染。

酵母菌
绝大多数酵母菌是对人类有益的益生菌。酵母菌除了能酿出美酒之外，还能具备多种改良土壤及作物生长的功能;

• 能够抵御除草剂和其他化学成分，減低作物受到土壤内除草剂残留的毒害。
• 酵母菌的细胞壁能吸附重金属离子，减低作物对土壤重金属的吸收，确保农产品安全质量。
• 具有同化硝酸盐的功能，可解决因化肥过量使用导致土壤盐渍化，引起连作障碍等问题。
  
  

山东寿光 - 大栅蕃茄